1. 蔡志祥、黄永豪、谢晓辉共同主编《边陲社会与国家建构》，台北：台湾稻乡出版社，2017。

        1. (2017) Competing for orthodoxy: the Territorial Kings and genesis of lineage among the Tujia, XieXiaohui, Asian Ethnicity, Vol. 18, No. 2.
        2. (2017)《重塑边疆：明代湘西苗疆的地方格局、族群政治与文化重构》，《边陲社会与国家建构》，台北：台湾稻乡出版社。
        3. (2014)《中原王朝对11世纪前湘西地区认知的变迁》，《广西民族大学学报》，2014年第5期，第92-98页。
        4. (2013)《帝国之在苗疆：清代湘西的制度、礼仪与族群》，《历史人类学学刊》，第11卷 (2013)，第51-88页。
        5. (2013) “From Woman’s Fertility to Masculine Authority: The Story of the Baidi Heavenly Kings in Western Hunan,” in David Faure and Ho Ts’ui-p’ing (eds.), From Chieftains to Ancestors: Incorporating Indigenous Society in Southwestern China, Vancouver: University of British Columbia Press, pp.176-215.
        6. (2012)《只愿贼在，岂肯灭贼？明代湘西苗疆开发与边墙修筑之再认识》，《明代研究》台湾, Vol.18, pp.47-80. 
        7. (2012)《联姻结盟与谱系传承——明代湘西苗疆土司的变迁》，《中国社会历史评论》, 第13卷，第306-337页。
        8. (2008)《苗疆的开发与地方神祗的重塑——兼与苏堂棣讨论白帝天王传说变迁的历史情境》，《历史人类学学刊》, 第6卷（2008年），第111-146页。        

        1、《唐代摩尼教史研究综述》，《新疆师范大学学报》2004年第4期。
        2、《新出汉文〈下部赞〉残片与高昌回鹘的汉人摩尼教团》，《西域研究》2005年第2期。
        3、《中国东南摩尼教研究评述》，《中国史研究动态》2005年第7期。
        4、《从大云寺到大云光明寺——对中原摩尼寺额的考察》，《文史》2005年第4辑。
        5、《中古波斯文〈摩尼教赞美诗集〉跋文译注》，《西域文史》2007年第2辑。
        6、《唐开元二十年禁断摩尼教原因辨析》，《中华文史论丛》2008年第2辑。
        7、《汴京卜肆与摩尼教神像入闽》，《故宫博物院院刊》2009年第3期。
        8、《唐后景教灭绝说质疑》，《文史》2010年第1期。
        9、《庇麻与头冠——高昌摩尼教圣像艺术的宗教功能》，《张广达先生八十华诞祝寿论文集》，台北，新文丰出版股份有限公司，2010年。
        10、《泉州草庵遗址明教属性辨识之学理与方法》（与林悟殊合撰），《中华文史论丛》2010年第3期。
        11、《中国东南摩尼教使用十字架符号质疑》，《艺术史研究》2010年第12辑。
        12、《高昌摩尼教艺术中的女神形象与教会中的女性教徒——以吐鲁番出土摩尼教残片III7283为例》，《丝绸之路上的考古、宗教与历史》，文物出版社，2011年。
        13、“Persian Zoroastrianism and the Worship of the God of Xian in Ancient China” (cooperate with Lin Wushu), Eurasian Studies Vol. I, 2011-2. 
        14、《唐大历、元和年间摩尼寺选址原因辨析》，《西域研究》2011年第3期。
        15、《五代陈州毋乙之徒非“末尼党类”辨》（与林悟殊合撰），《中国史研究》2012 年第2期。
        16、《日本大和文华馆藏摩尼教绢画》，《唐研究》2012年第18卷。

        1. 2017-2020. 项目主持人，国家社会科学基金项目，一般项目，《清代湘西地区改土归流与开辟苗疆的比较研究》。
        2. 2017-2019. 项目主持人，中山大学青年教师培育计划：“清代湘西苗疆地区与土司地区社会变迁的比较研究”，高校基本科研业务费。
        3. 2015-2018. 项目主持人（与李文良教授合作主持），合作研究计划：Negotiating the Southern Frontiers in the Qing Empire: A Comparative Study on the Frontier Boundaries and Local Society in Taiwan and Western Hunan，funded by the Chiang Ching-kuo Foundation for International Scholarly Exchange.（后因工作调动的关系，项目已经请合作者主持，本人仅参与）。
        4. 2010-2017. 课题组成员，香港卓越学科领域计划：“中国社会的历史人类学”，香港特别行政区大学教育资助委员会(The Historical Anthropology of Chinese Society, the Fifth Round of Areas of Excellence (AoE) Scheme, The University Grants Committee, Hong Kong Special Administrative Region）
        5. 2010-2014.课题组成员，台湾中央研究院深耕计划：“近代宗教与族群关系之演变——以湘西地区的道教跟苗族之互动为讨论中心”，（The Tao among the Miao: The Transformation of Religious Traditions and Ethnic Identities in Western Hunan during the Modern Era），台湾中央研究院资助
        6. 2007-2010. 课题组成员，合作研究计划：“重新定义西江：明清时期国家的建构与土著社会的变迁”，香港特别行政区大学教育资助委员会（Redefining the West River: Ming and Qing State Building and the Transformation of Native Society, Collaborative Research Fund, The University Grants Committee, Hong Kong Special Administrative Region）
        7. 2005-2008. 课题组成员，合作研究计划: The Conversion of Chieftains: Territorial Gods, Chieftain Lineages, and the Retention of Indigenous Identity in Border Areas, funded by the Chiang Ching-kuo Foundation for International Scholarly Exchange
        8. 2005-2008. 课题组成员，教育部人文社科研究项目，《湘、黔民族地区汉文民间文献的收集与研究》。
 

　　教育部人文社会科学重点基地——香港中文大学-中山大学历史人类学研究中心(2012～现在)
　　中华炎黄文化研究会土司文化专业委员会常务理事（2016～现在)

　　香港中文大学亚太汉学研究中心访问学人